2023-04-19 17:46:21 来源 : 互联网
一、单细胞测序行业概述
细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。
(资料图)
目前,最常见的单细胞测序的应用是在肿瘤研究上。来自美国和英国的研究人员近日利用单细胞基因组扩增、测序和装配,从海洋样本中鉴定出一个单细胞细菌。单细胞测序方法即single cell sequencing(SNS),能准确定量一个单细胞核中基因拷贝数目。由于癌细胞中基因组部分被删除,或者扩增,从而引起关键基因的缺失,或者表达过量,干扰正常细胞生长,因此利用这种方法就能分析基因拷贝数目,从而诊断癌症。
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。
二、单细胞测序行业发展现状分析
随着第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术和第三代测序( third generation sequencing,TGS)技术的飞速发展,引起生物研究领域的巨大变革。以前,需要从大量细胞中获取足够多的DNA进行测序,因此测序结果是这些细胞"整体"的表征。然而,由于细胞异质性,相同表型的细胞的遗传信息可能存在显著性差异,很多低丰度的信息会在整体表征中丢失。为了弥补传统高通量测序的局限性,单细胞测序技术应运而生。
值得注意的是,受数据样本量小、人工干预多、过度依赖marker gene(已报道的特异性基因)等因素的影响,单细胞测序细胞类型注释技术一直面临着泛化性、可解释性、稳定性均比较低的问题,现存的算法难以有更广泛的应用。针对以上问题,论文中首次提出“基于大规模预训练语言模型的单细胞转录组细胞类型注释算法”,即“scBERT”模型,首次将“transformer”(自然语言处理算法经典计算单元)运用到单细胞转录组测序数据分析领域。
单细胞技术已经成为现代生命科学研究中不可或缺的有力工具,通过单细胞技术得到的数据没有掩盖细胞群体的内在异质性,随着其在分离、标记、通量和深度等方面的进步,该技术将会提供更深刻的生物学观点。随着对单细胞测序的研究越来越成熟,生物制药和生物技术公司开发市场产品的规模将会持续增长。
根据中研普华产业研究院发布的《2023-2028年全球及中国单细胞测序行业发展现状调研及投资前景分析报告》显示:
在基因层面,单细胞测序可以获取更精准的遗传信息,在蛋白层面,通过分析单细胞表达的蛋白可以直接的获取人体免疫相关的靶点,用于免疫诊断、新药研发等。鉴于蛋白质不具有直接扩增的特性,以及蛋白质组学分析灵敏度的限制,单细胞蛋白分析的常见、有效技术是质谱分析,主要技术包括质谱流式细胞术(Mass Cytometry)、TOF-SIMS(飞行时间二次离子质谱仪)分析等。
质谱流式技术平台最初由美国DVS Science开发,但这家企业于2014年被美国Fluidigm以2.1亿美元收购。国内单细胞蛋白分析的代表企业为宸安生物、普罗亭,其中,宸安生物专注单细胞质谱流式诊断设备、试剂和软件开发,普罗亭致力于以单细胞蛋白层面研究为核心的检测服务。
2022年,墨卓生物科技(浙江)有限公司(以下简称“墨卓生物”)宣布完成近亿元A+轮融资,本轮融资由LYFE Capital(洲嶺资本)领投,老股东源码资本和地方政府引导基金云祥基金跟投,全面支持公司发展。据悉,本轮融资所募资金将主要用于进一步扩充公司单细胞产品研发管线,大力推进全球独有的高通量微生物单细胞基因组学平台(MobiMicrobe™)的研发和推广,并持续推进各产品的研发生产、商业化落地和市场的开拓,着力加速和其他的产业从业者一同打造多元、高效的单细胞生态系统。
三、全球不同应用单细胞测序规模及预测
单细胞技术已经成为现代生命科学研究中不可或缺的有力工具,通过单细胞技术得到的数据没有掩盖细胞群体的内在异质性,随着其在分离、标记、通量和深度等方面的进步,该技术将会提供更深刻的生物学观点。随着对单细胞测序的研究越来越成熟,生物制药和生物技术公司开发市场产品的规模将会持续增长。
展望未来,相信随着定量、通量和易用性的单细胞分析工具的增加,单细胞技术的影响可能会从根本上改变生物学科以及相关的应用学科,促进药物的发现和开发,市场规模将会持续增加,单细胞测序应用将会越加成熟。
随着全球及中国单细胞测序行业竞争的不断加剧,大型企业间并购整合与资本运作日趋频繁,国内外优秀的全球及中国单细胞测序企业愈来愈重视对行业市场的分析研究,特别是对当前市场环境和客户需求趋势变化的深入研究,以期提前占领市场,取得先发优势。正因为如此,一大批优秀品牌迅速崛起,逐渐成为行业中的翘楚。
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